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python-biopython  1.60
Namespaces | Variables
local_blast.py File Reference

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Namespaces

namespace  local_blast

Variables

tuple local_blast.my_blast_db = os.path.join(os.getcwd(), 'at-est', 'a_cds-10-7.fasta')
tuple local_blast.my_blast_file
tuple local_blast.my_blast_exe = os.path.join(os.getcwd(), 'blast', 'blastall')
tuple local_blast.b_parser = NCBIStandalone.BlastParser()
tuple local_blast.b_iterator = NCBIStandalone.Iterator(blast_out, b_parser)
tuple local_blast.b_record = b_iterator.next()
float local_blast.E_VALUE_THRESH = 0.04
string local_blast.dots = '...'